藥學(xué)系開設(shè)有藥學(xué)、生物制藥技術(shù)、藥品經(jīng)營(yíng)與管理,、藥品生產(chǎn)技術(shù)4個(gè)專業(yè),。藥學(xué)專業(yè)群獲批福建省高水平專業(yè)群A類項(xiàng)目，與福建省醫(yī)藥集團(tuán)有限責(zé)任公司共建福建醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)學(xué)院獲批福建省職業(yè)院校產(chǎn)業(yè)學(xué)院試點(diǎn)項(xiàng)目,。

藥學(xué)系建有一支高學(xué)歷高水平的雙師型教學(xué)團(tuán)隊(duì)，碩士以上學(xué)歷69.8%，博士11.1%,，高級(jí)職稱25.9%，雙師型教師93.9%,，長(zhǎng)期聘請(qǐng)醫(yī)藥行業(yè),、省（市）藥檢所及各級(jí)醫(yī)院專家擔(dān)任客座教授和兼職教師,。教學(xué)團(tuán)隊(duì)主持修訂國(guó)家專業(yè)標(biāo)準(zhǔn)2項(xiàng),，主持或參編“十四五”規(guī)劃教材10門，獲省級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)和二等獎(jiǎng)各1項(xiàng),，主持或參與教科研課題92項(xiàng),；獲教育部技術(shù)技能大師1人、世界技能大賽中國(guó)技術(shù)指導(dǎo)專家1人,。

藥學(xué)系擁有1個(gè)世賽福建集訓(xùn)基地,、2個(gè)省級(jí)實(shí)訓(xùn)基地、4個(gè)省級(jí)創(chuàng)新服務(wù)平臺(tái)和教育部“一站式”學(xué)生社區(qū)綜合管理模式建設(shè)自主試點(diǎn)單位,。獲批教育部體重管理和藥品購(gòu)銷員“1+X”證書試點(diǎn)單位,。開展“醫(yī)藥商品購(gòu)銷員(藥品購(gòu)銷員)”和“化學(xué)檢驗(yàn)員”技能等級(jí)認(rèn)定，紅十字現(xiàn)場(chǎng)救護(hù)員培訓(xùn),，職業(yè)技能證書獲取率100%,。與福建省醫(yī)藥集團(tuán)有限責(zé)任公司、省立醫(yī)院,、省二人民醫(yī)院,、麗珠福興、廈門片仔癀宏仁醫(yī)藥有限公司,、廈門市古今湖濱藥店連鎖有限公司,、福建好安心、福建康佰家,、福建廣生堂藥業(yè)等100多家企事業(yè)單位共建校企教學(xué)實(shí)踐基地,，為學(xué)生實(shí)習(xí)就業(yè)提供了良好條件,。畢業(yè)生深受用人單位歡迎，近兩年畢業(yè)生去向落實(shí)率達(dá)100%,。

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